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如何使用NCBI工具 使用NCBI工具的步驟

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如何使用NCBI工具 使用NCBI工具的步驟

文章插圖
1、首先進入NCBI主頁 。
Map view演示，主要是找到相關基因在染色體上的位置，以人類IL-6基因為例 。點擊Map View 。
2、選擇物種 ， 點擊Go；設置filter，過濾信息；點擊Genes seq查詢序列
3、最后進入序列下載頁面 ， 可以直接下載 。可以選擇多種格式，一般選擇fasta 。
4、通過clone查詢相關基因的cDNA序列，選擇clone數據庫，search基因描述 。
5、對基因的蛋白質序列和mRNA查詢 。
6、也可對序列進行查詢 。基因組展示 。
7、也可以查詢序列信息 。
8、查詢已知引物，通過probe數據庫搜索 。
【如何使用NCBI工具 使用NCBI工具的步驟】9、同源性比對blast 。有多種比對方式 。DNA,RNA,Protein等比對模式，排列越高表示同源性越強 。也可以進行引物比對 。