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研究人員發現鹿攜帶SARS-CoV-2變體，這種變體在人類中已經滅絕

人類


研究人員發現鹿攜帶SARS-CoV-2變體，這種變體在人類中已經滅絕


對SARS-CoV-2進行采樣和測試的WTD人群的人口統計學 。在紐約州（NY）狩獵第一季（2020年9月至12月 ， n=2700）和第二季（2021 9月至十二月，n=3762）期間 ， 從自由放養的狩獵采集的WTD中采集咽后淋巴結（RPLN）樣本 。（A） 紐約州的抽樣分布和陽性率 。在第一季的17個樣本（0.6%）和第二季的583個樣本（21.1%）中檢測到SARS-CoV-2 RNA 。（B） 紐約州每個縣第1季和第2季SARS-CoV-2陽性樣本的比例 。（C） 紐約WTD SARS-CoV-2感染的高風險地區或熱點 。對第二季的樣本進行空間聚類分析（n=2762） 。確定了19個空間簇（C1至C19），其中包含在彼此相距10.6至55km的半徑內采集的3至57個陽性樣本 。圖中突出了WTD中SARS-CoV-2感染高危的七個熱點（相對風險[RR]>1.76） 。（D） 在第一季和第二季期間，根據WTD的性別和年齡收集的樣本總數 。動物分為以下三個年齡組：小于1.5歲（小鹿）、≥1.5歲且小于2.5歲（一歲）和≥2.5歲（成年） 。（E） SARS-CoV-2陽性樣本數量——基于第一季和第二季WTD的性別和年齡 。（F） 在第一季和第二季期間，基于WTD性別和年齡的陽性樣本比例 。資料來源：《美國國家科學院院刊》（2023） 。DOI:10.1073/pnas.2215067120
據美國物理學家組織網（作者：Cornell University）：康奈爾大學的研究人員發現，北美數量最多的大型哺乳動物白尾鹿體內含有SARS-CoV-2變體 ， 這種變體曾廣泛傳播 ， 但在人類體內已不再存在 。
隨著科學家們不斷收集和分析新的數據，鹿是否能成為這些過時變種的長期儲存庫仍然未知 。
這項研究于1月31日發表在《美國國家科學院院刊》上，是迄今為止評估白尾鹿SARS-CoV-2流行率、遺傳多樣性和進化的最全面研究之一 。
康奈爾大學人口醫學和診斷科學副教授Diego Diel說：“這項研究最引人注目的發現之一是在這一野生動物種群中檢測到三種致癌物-α、γ和δ-的共同循環 ?！?。
在大流行過程中 ， 鹿通過與人類的持續接觸感染了SARS-CoV-2，可能來自狩獵、野生動物康復、喂養野生動物或通過廢水或水源 。
Diel說：“一種病毒在亞洲的人類身上出現 ， 很可能是在從動物庫溢出到人類體內之后，顯然，或可能是在北美發現了一種新的野生動物庫 。” 。
研究中使用的5700個樣本是在2020-22年間在紐約收集的 。
當研究人員將在鹿中發現的變體的基因組序列與從紐約各地的人類身上獲得的相同變體的序列進行比較時 ， 他們發現這些病毒在鹿中發生了變異，這表明這些變體可能已經在鹿中傳播了好幾個月 。例如，當在鹿中檢測到α和γ變體時 ， 沒有證據表明這些病毒株仍在人類中傳播 。事實上 ， 當它們在鹿身上被發現時，在紐約的人類身上已經有四到六個月沒有發現這兩種變體 。
迪爾說：“當我們將從白尾鹿中回收的病毒與人類序列進行序列比較時，我們觀察到病毒基因組中有大量突變 ?！彼a充說，與人類序列相比，一些病毒有多達80個突變，這進一步證明了病毒可能在鹿中傳播了一段時間 。這些突變表明 ， 這種病毒已經適應了鹿 ， 可能使它們之間的傳播能力更強 。
需要更多的研究來確認這些變異是否會隨著時間的推移在鹿中消失，或者SARS-CoV-2是否有傳播到其他野生動物（包括捕食者）的風險 。
迪爾說：“由于我們研究中獲得的證據，繼續監測這些動物種群中的病毒非常重要，以真正了解和跟蹤可能導致或有利于向人類和其他野生動物傳播的變化 ?！?。
據估計，美國有3000萬只白尾鹿 。Diel等人于2022年進行的一項研究發現，在2021調查的五個州中 ， 40%的白尾鹿體內發現了SARS-CoV-2 。