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保存糞便的DNA揭示了古代日本腸道環境

DNA


保存糞便的DNA揭示了古代日本腸道環境


測到的腸道細菌的系統進化樹 。該樹顯示了4，616個細菌物種的系統發育關系 。鳴謝:西村等人 ， 2024年，PLOS ONE，CC-BY 4.0（creativecommons.org/licenses/by/4.0/）
據公共科學圖書館：根據發表在《PLOS ONE》上的一項研究 ， 來自古代糞便的DNA可以為考古學家提供有關生活在幾千年前的日本人的生活和健康的新線索 。這項研究是由日本國家遺傳學研究所的盧卡·西村和伊圖羅·井上、東京大學的Hiroki Oota、和歌山歷史博物館的Mayumi Ajimoto及其同事完成的 。
糞便化石，也稱為糞化石，可以保存來自古人消化道的一系列遺傳物質 。這包括生活在他們消化系統中的微生物和病毒的DNA所有這些都可以幫助考古學家了解他們文化和生活方式的更多細節 。
在這項研究中，研究人員分析了在日本鳥濱貝殼丘考古遺址收集的四個糞化石中留下的遺傳痕跡，以評估從這些樣本中可以確定古代人生活的哪些細節 。
糞便樣本的年齡在5500至7000年之間，可以追溯到島鏈的繩文時代早期 。研究人員從糞化石中集體采樣了所有的遺傳物質，并將他們發現的DNA與已知的遺傳序列進行了比較 。在糞便樣本中，他們發現了與人類β皰疹病毒5型和人類腺病毒f型具有同源性的病毒DNA片段 。
DNA會隨著時間的推移而分解 ， 因此糞化石中的基因組通常是高度碎片化的 。但是盡管出現了這種退化，研究人員仍然能夠評估幾千年前人類消化系統中可能存在的微生物和病毒種類 。
此外，作者認為糞化石中病毒和細菌遺傳物質的保存可能有助于科學家探索細菌和感染這些細菌的病毒是如何隨著時間的推移共同進化的 。