基因組測序推進了難測血癌的早期診斷 _細胞

對重新排列的T細胞受體（TCR）基因進行高通量測序為皮膚T細胞淋巴瘤中的T細胞群提供了前所未有的信息。在獲取皮膚活檢或外周血樣本之后，被提取的基因組DNA被PCR放大，被放大的目標片段是所有可能會有的TCR重新排列。TCR測序數據揭示了一個T細胞克隆的存在；該克隆被定義為過度表現、重新排列的TCR基因，它提供了達到克隆閾值的特定V(D)J 序列。（C. Bickel / Science Translational Medicine）
（報道）據EurekAlert!：高通量基因組測序或能為罹患皮膚T細胞淋巴瘤（CTCL）患者的診斷提供一種有價值的工具；CTCL是一種很難檢測的血癌，它常被誤做濕疹或皮炎等良性的皮膚病。這種方法還就該病的生物學提供了新的見解，它能準確地診斷CTCL患者（包括疾病早期和復發者），并證明比目前標準臨床試驗的敏感性和特異性更高。
在 CTCL患者中，癌性T細胞在皮膚中累積，它不但引起皮膚腫瘤，也會引起皮疹，后者常被錯誤地看做是良性的皮膚炎性疾?。?使其在臨床上的診斷平均被延誤6年。在皮膚病灶中的健康T細胞數量遠遠超過惡性T細胞的數量，使得用標準臨床試驗來檢測CTCL頗具挑戰性。
在尋找新的診斷方法的過程中，Ilan Kirsch和同事用高通量測序（HTS）來分析46名CTCL患者的血液和皮膚組織樣本中的T細胞受體基因，并將其與健康人和牛皮癬、濕疹及其它非癌性炎癥性皮膚病的皮膚樣本進行比較。通過識別及量化惡性T細胞，該技術在所有46名患者中準確地將CTCL與其它皮膚病區分開來。相反，聚合酶鏈反應（這是最常用的CTCL診斷測試方法）只能正確地診斷70%的癌性樣本，且常常錯失對早期癌癥的診斷。
研究人員在一個病人的亞組中用HTS來追蹤惡性T細胞隨時間的變化，使其能檢測到該病的早期復發并能對病人的治療反應進行監控。T細胞受體測序還揭示了對CTCL細胞起源（一直仍未弄清）的新的了解。研究人員發現，該癌癥源自成熟的T細胞而非不成熟的T細胞，這或能指導設計更有效的療法 ?？傊?，這些發現提示， HTS為指導早期診斷及CTCL患者的治療提供了一種有前途的工具。
由 Jason Weed 和 Michael Girardi 撰寫的相關《焦點》對將HTS推進成為一個臨床診斷工具的前景和挑戰進行了討論。